单位内设有职业卫生评价所、放射卫生防护所、毒理实验所、毒化监测所、物理因素监测所、辐射损伤防治所、中毒防治所、职业健康监护所、职业医学检验科和《中国职业医学》编辑部等 22 个科室。获中国实验室国家认可委员会(CNAL)实验室认可,并获得卫生部化学品毒性鉴定甲级资质,建设项目职业病危害评价(职业卫生)甲级等资质,获得农业部农药登记毒理学安全性评价 A 级资质,国家环保总局化学品安全性毒理学评价认可单位。被卫生部评为「国家临床重点专科(职业病科)」。被广东省科技厅确定为「广东省职业病防治重点实验室」。