九江市第三人民医院，由原市三医院(创建于1972年)和原市传染病医院(创建于1954年)于1995年合并组建而成，2002年经市政府批准挂牌成立九江市肿瘤医院，2003年非典后，政府在濂溪区威家镇投资新建突发公共卫生事件应急救治医院——九江市第三人民医院马祖山分院，2021年增名南昌医学院附属九江医院，2022年增挂九江市癌症中心。医院现已建设成为以肿瘤诊疗、肝病诊疗、结核病诊疗和急性传染病诊疗为专科特色，其他综合学科迅速发展的三级甲等医院。
医院占地面积3.18万平方米，建筑面积5.02万平方米。设有24个病区，临床、医技科室66个，编制床位930张，实际开放床位1080张。现有职工962人，其中博士和硕士共65名，九江市“双百.双千”人才3名，国家自然科学基金项目评审专家1人，九江市知名中青年医学专家3人，硕士生导师2人。院士工作站1个（陈芬儿院士九江药学工作站），九江市重点建设实验室1个（艾滋病创新药物研究），九江市名医工作室2个（肿瘤学、肝病学），是九江市肿瘤科、放射治疗科、感染科、传染科和结核病诊疗质量控制中心挂靠单位。
医院主要临床科室有肿瘤病区(6个科)、肝科病区(3个科)、结核病区(2个科)、急性传染病科。同时，开设了脑外科、骨科、普外科、胸外科、胃肠外科、肝胆外科、血管外科、泌尿外科、疼痛科、妇产科、妇瘤科、乳腺科、心血管内科、内分泌科、消化内科、呼吸与危重症医学科、肾病科、中医科、骨伤科、儿科、男性科、耳鼻喉科、皮肤科等综合科室，形成了专科特色。其中肿瘤科、胸部肿瘤科、呼吸介入科、结核科为省市共建医学学科，肝病科为江西省重点建设学科。是全国中医药防治传染病临床基地、全国肝胆病防治技术示范基地和全国乙肝母婴零传播工程实施单位。
医院仪器设备先进。拥有三维适形精确放射治疗系统、西门子医用直线加速器、瓦里安Halcyon医用直线加速器、飞利浦大孔径CT模拟定位机、瓦里安三维后装近距离治疗机、德国西门子SYPMHONY1.5T磁共振系统、日本岛津大型C臂X线机、德国西门子SOMATOM SPIRIT全身螺旋CT机、荷兰菲利普1200mA大型全身直接数字化成像系统（DR）、免疫三氧治疗系统、人工肝支持系统、日本电子胃肠镜、日本OLYMPUS支气管镜、美国三维彩色多普勒超声诊断仪、全自动微粒子化学发光检测仪、全自动肝炎病毒基因扩增检测仪等先进设备。
