深圳市妇幼保健院始建于1979年，2002年4月与原深圳市妇女儿童医院合并，目前已发展成为集妇幼保健、医疗、教学、科研为一体的颇具规模的三级甲等妇幼保健院。全院一院两址，分红荔院区和福强院区，共开放床位790张。
医院产科设有生理、病理产科和产科危重症监护病区(MICU)以及VIP产房；妇科设有肿瘤、内分泌、计划生育、生殖感染、复发性流产、人工辅助生殖、妇科腔镜微创和宫颈等专科；儿科设有儿内科、新生儿科、新生儿危重症监护病区（NICU）和儿童重症监护病区（PICU）；中医科设有中医妇科和针灸推拿科；以及乳腺科、口腔保健科、妇女保健科、儿童保健科、内科、五官科、皮肤科、理疗科和体检中心等科室。
拥有1个国家临床重点学科：新生儿科；2个广东省临床医学重点学科：产科、儿科；1个广东省“十二五”中医重点（特色）专科：中医妇科；1个深圳市重点实验室：深圳出生缺陷预防控制重点实验室；2个深圳市级医学重点学科：孕产妇危重症诊治中心、产前诊断中心；4个院内重点学科：妇科、儿童保健科、超声科、口腔病防治中心。
目前是卫生部产前超声诊断技术培训基地、广东省区域性产前诊断中心、全国城市“子宫颈癌早诊早治示范基地”、“吴阶平医学基金会乳腺癌早诊早治项目培训基地”、全国综合医院中医药工作示范单位、全国卫生系统先进集体、流产后关爱（PAC）项目优质服务医院、国家优质护理示范工程——围产期母婴护理服务实训基地、南方医科大学附属深圳妇幼保健院、武汉大学口腔医学院教学医院、中山大学医学院、广州医学院、广州中医药大学等多所院校的教学基地。
