小儿消化、小儿感染科科
小儿消化科、小儿感染科设于东莞市儿童医院儿科五区，是广东医科大学附属东莞市儿童医院重点发展学科。目前拥有独立专科病房（其中设置床位 30 余张）、消化科专科门诊及感染专科门诊。小儿消化科设有儿童胃肠镜室，拥有奥林巴斯、宾得进口电子胃肠镜等先进设备，首次在东莞地区开展配备最小直径 5 mm 婴幼儿及儿童专用型号的胃镜及肠镜诊疗技术；另外率先在东莞地区开展安全性更高的碳 13 呼气试验检测幽门螺旋杆菌。科室目前拥有高水平医护人员 30 余名，其中全国儿童感染专业委员会委员 1 名，高级职称人员 3 名，中级职称人员 6 名，硕士研究生 2 名。科内大部分医护人员曾赴国内著名儿童医院，如浙江省儿童医院及广州市妇女儿医疗中心专科进修深造，具有丰富的临床诊治经验。
小儿消化科：作为医院发展重点科室，小儿消化科致力于儿童急性胃肠炎、消化不良、消化道出血、消化道溃疡、营养不良、胰腺炎、婴儿肝炎综合征等疾病诊治。对反复腹痛、慢性腹泻、牛奶蛋白过敏症、生长发育迟缓的营养干预等方面积累了丰富临床经验。同时率先在东莞地区开展无痛小儿胃肠镜检查，包括胃镜下消化道异物钳取术、经内镜上消化道止血术、肠镜检查术、肠镜下肠息肉摘除术、内镜下粘膜活检术等，均取得很高的社会效应及患儿家长的高度认可，总体实力居于东莞地区前列。
小儿感染科：作为东莞市手足口病重症病例收治单位，长期承担着东莞地区儿童传染性疾病的医疗及防治任务。主要负责各种儿童感染性疾病的诊治，如麻疹、水痘、流行性腮腺炎、巨细胞病毒感染、EB 病毒感染等常见病，尤其在重症手足口病诊断、治疗和预防工作中有比较高的造诣。医疗技术达到省内前列。